昂朴生物CEO窦同海博士：做更精准的基因检测，搭建患者与治疗手段之间的高效桥梁|【峰客访谈】
在不久前医麦客举办的以“蓄力前行，助航新生”为主题的2021 CSGCT 基因与细胞治疗医学峰会——罕见病药物开发论坛上，昂朴生物CEO窦同海博士为我们做了《罕见病基因治疗常用脱靶效率检测方法比较》的主题分享。会后，医麦客峰客访谈团队有幸对窦同海博士就精准基因检测相关问题进行专访。
聚焦细胞与基因治疗产业化，2021 CSGCT开启国内创新药变革之路！
昂朴生物CEO窦同海，复旦大学遗传学博士，国家教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖获得者。主持或参与国家与省市级课题十余项，发表国际论文30余篇，其中与华山医院神经内科、复旦大学生命科学学院共同对一种罕见神经遗传病眼咽远端肌病定位相关基因GIPC1，研究成果发表在神经领域国际顶级杂志《Brain》上，填补了国际上该病病因的空白。
根据临床选方法，让结果更精准
罕见病80%都是遗传性疾病，其发病率低，种类繁多且表型复杂多样。过去，仅靠经验或者传统的临床诊断方法，难以进行及时和准确的诊断。如今测序技术的广泛应用，有助于从本质上揭示罕见病的“神秘面纱”，从而成为罕见病临床诊断的分水岭。自1977年的第一代测序技术发展至今，已经产生了各种具有独特优势，适用于不同场景的基因检测方法。
窦同海博士表示：“尽管基因检测方法众多，但国际上对检测方法的选择还未有明确规定。目前，大家都是摸着石头过河，暂无金标准去选择。但是因为不同的测序方式对不同的测序类型会各有侧重，比如三代测序更适合结构性变异或者长序列，二代测序对于点突变的判读具有优势，而一代测序准确率高可应用于验证，所以昂朴生物结合临床诊断及鉴别诊断的疾病特点选择基因分析方式，以期能匹配最合适的检测方法，明确病因，辅助临床治疗。”
作为中国罕见病联盟单位，围绕罕见病，在神经遗传病、内分泌遗传病、眼科遗传病、心血管病、颅骨发育不全、遗传性肿瘤、全外显子测序和全基因组测序等方面，昂朴生物主要运用高通量测序、动态突变检测、MLPA和QPCR等方法进行精准基因诊断。其完善合适的检测方法、测序覆盖度和数据分析流程提高了阳性突变的检出率，细分病类阳性检出率可达70%。几乎所有的疾病基因检测均可根据客户需求个性化定制，优化精准诊断流程。并且检测的结果准确可靠，其一代测序验证相符率高达100%。
值得一提的是，在已公布经典案例中，昂朴生物为一位17岁的男性患者采用高通量测序技术对全部约25000个基因进行全外显子区域测序，并从中精准检出1个匹配受检者临床表型的致病性AVP基因变异，从而验证了临床预判。
独家专利算法，让分析更精确
完成基因精准检测相当于走出了万里长征关键一步，而方向是否正确依赖于对海量检测数据的精准分析。正如窦同海博士所说：“测序数据的获取相较以往而言是更加容易的，但是随着数据量及突变类型的增加，对数据的精准判读是具有一定挑战的。而作为检测方，只有创新性地去攻克这个问题，才能更好地服务于临床及科研。”
据窦同海博士介绍，作为高新技术企业和区“专精特新”企业的昂朴生物已拥有近30项软件著作权，围绕基因组数据开发了不同的算法，用以从海量数据中分析和判断特定的突变类型。
在一例眼科检测案例中，昂朴生物于患者的USH2A基因上发现两个杂合变异点，其中一个位于63号外显子上，经过软件分析及预测，此点为错义突变，该突变对蛋白功能的影响为有害(SIFT)，有害(Polyphen2)，另一个位于54号外显子上，为无义突变。该患者一个变异位点来自父亲，另一个变异位点来自母亲，符合遗传规律，并且显示了突变的频率和相关参考文献相符。昂朴生物的精准基因检测，为临床诊断及治疗提供更加精准明了的数据分析报告。
搭建桥梁，双向促进
同时，窦同海博士表示：“在精准检测与分析的基础上，我们致力于建立患者与治疗手段之间的高效桥梁，积极推动罕见病的筛查诊断的同时赋能基因治疗。将基因治疗的安全性置于检测之下，有利于罕见病的基因治疗发挥最大价值。”
据悉，在患者端，昂朴生物已与国内近百家高水平三甲医院建立了密切合作关系，覆盖21大类疾病的创新医疗检测项目，近2000多种细分病种诊断相关基因检测在临床应用并推广，并形成了涵盖多疾病领域2万以上成功服务案例，自建疾病频率数据库。同时，现实的发展与窦同海博士“前沿技术终将造福人类社会，基因检测发展充满可能”的想法契合，基因检测已经从单基因遗传疾病专业范畴扩展到复杂疾病和个体化应用更加广阔的领域。昂朴生物已将其应用于罕见病个体化解决方案上，通过遗传病临床基因检测、致病基因研究与新致病基因定位以及iPSC疾病细胞模型制备、分化与机制研究，为罕见病精准诊断、科学诊疗以及药物研发提供有希望的解决方案。
患者端不断积累的数据成为昂朴技术的重要支撑，同时这些数据将进一步促进罕见病基因治疗药物的研发。在与生物医药企业及研究机构的合作中，昂朴生物设计了包含基因表达分析、表观遗传分析、基因突变分析、宏基因组测序分析、基因组测序分析5个方面共16种方案，目前已经与多家企业达成合作。
“目前，患者端与研发治疗端已经形成了相互促进的良性循环。为此，我们也建立了自己的第三方医学检验所和IVD试剂GMP厂房作为后续可持续发展的重要保障。作为泛长三角神经肌病联盟秘书单位，我们的业务布局立足长三角，辐射全国，期望构建良好的疾病联盟平台，为人类攻克神经遗传病贡献科技力量。”窦同海博士补充道。
精益求精，未来可期
以情怀致事业，以初心致未来，砥砺深耕，精益求精。这也是窦同海博士在演讲及采访中给人留下的深刻印象。我们相信在这样一位CEO的带领下，昂朴生物一定能为患者或高危人群提供更加精准的诊断及预防建议，也能为科研提供至关重要的支撑，最终为生命搭建通往希望的桥梁。
昂朴生物CEO窦同海，复旦大学遗传学博士，国家教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖获得者。主持或参与国家与省市级课题十余项，发表国际论文30余篇，其中与华山医院神经内科、复旦大学生命科学学院共同对一种罕见神经遗传病眼咽远端肌病定位相关基因GIPC1，研究成果发表在神经领域国际顶级杂志《Brain》上，填补了国际上该病病因的空白。